طبق اساسنامه اولیه در زمان تشکیل که دارای ۴۶ ماده بوده است، هیئت مدیره دارای ۲۸ نفر عضو بوده که با نظارت انجمن اکابر پارسیان هندوستان و تحت نظر نماینده آن انتخاب می شدند و گزینش رئیس هیئت مدیره بر عهده اعضا بوده است. بنابر ماده ششم و با صلاح دید کیخسرو جی خانصاحب ، دستور شهریار نخستین سرنشین و دستور تیرانداز نخستین جانشین سرنشین انجمن ناصری یزد بوده است.
محل تشکیل جلسات انجمن ناصری، در ساختمان دبستان کیخسروی که از دهش ملا کیخسرو ابن مرحوم ابن مهربان بوده، برگزار می شده است، که بعدها به مجتمع تجاری مارکار و سپس به مکان فعلی در ساختمان اهدایی برادران زرتشتی واقع در محله دستوران منتقل گردید.
انجمن زرتشتیان یزد، از دیرباز تا کنون مسئول رسیدگی به امور دینی و فرهنگی و اجتماعی و … زرتشتیان بوده و هست و در حال حاضر همچون گذشته با همت فراوان و حمایت جامعه زرتشتی در حال انجام وظیفه می باشد. در حال حاضر برگزاری جشن ها و آیین های دینی همچون واج یشت گاهانبار، جشن های ماهانه همچون نوروز، مهرگان، تیرگان و … و اداره و رسیدگی به آتشکده زرتشتیان یزد، در مهر نوش، در مهر کهن، آرامگاه و دخمه زرتشتیان یزد و دیگر اماکن مذهبی را در دستور کار خود دارد.